硝化作用由硝化細菌來執行,能將氨分兩階段最終轉化為硝酸。含氮化合物是否能有效轉化為硝酸,還是僅轉化為氨,主要取決于硝化細菌是否存在。如果有硝化細菌存在,它可以把氨氧化為亞硝酸(中間產物),以致硝酸(最終產物),從而獲得維生及繁殖的能源。
硝酸是一種強酸性化學物質,溶解于純水中會導致pH下降。由于自然水體的緩沖作用系統也能適度抵消硝酸對pH的影響,所以少量的硝酸溶解其中,可能仍無法改變自然水的pH,但會削減對H+緩沖容量。當硝酸的產量不斷增多時,緩沖作用系統逐漸失去緩沖H+的功能,最終會導致pH下降。
硝酸的產量會受到硝化作用強度的直接影響,即當硝化作用強度越強時,硝酸的產量也會因而增加。硝化作用強度又與氨的濃度、pH、溶氧量、溫度,以及硝化細菌數量等有關。例如,當氨的產量較多、高溶氧量,或溫度和pH適當時,通常會有較激烈的硝化作用,導致硝酸的產量大幅增加。因此,pH也會受到這些環境因子的間接影響而有降低之趨勢。