溫度下降，微生物的繁殖速度也會隨之減慢，要及時補充耐低溫菌維持生化池的處理效率。下面簡單介紹低溫對微生物的影響。
一、影響酶的活性 (微生物生長過程中所發生的一系列化學反應絕大多數是在特定酶催化下完成的，溫度下降，微生物細胞內酶的活性也隨之下降，使得生化反應速率減慢，影響細胞物質的合成，進而影響微生物對污染物的降解速度和降解能力。這是因為低溫會降低分子的熱運動能量，減少反應物分子之間的碰撞頻率和能量，從而限制了酶催化反應的進行);
二、影響細胞質膜的流動性 (低溫會導致細胞質膜流動性降低，使得細胞膜的滲透性減弱，不利于物質運輸，影響營養物質的吸收與代謝產物的分泌) ;
三、溫度持續下降的過程中，微生物細胞內原生質濃度增加、黏度增加、膠體吸水性下降，嚴重影響細胞活性。